علی افشاری از عناصر ضد انقلاب در مطلبی که در سایت های ضد انقلاب منتشر شد،شدت گرفتن اختلافات میان فتنه گران داخل و خارج از کشور را به نمایش گذاشت و بر عبور از میرحسین موسوی تاکید کرد.
علی افشاری با تردید نسبت به تداوم و رشد فتنه انگیری ها نوشته است:
واقعیت جنبش سبز ،تعدد ،تنوع و پراکندگی گرایش ها است. البته این تنوع هنوز نتوانسته حالت مناسب و سازنده پیدا کند و از مرحله قرار گرفتن دیدگاه های مختلف و نا متجانس کنار همدیگر به ائتلاف نیروهای گوناگون حول یک برنامه مشخص سیاسی ارتقاء یابد. در واقع از حالت جماعت به جنبش اجتماعی سازمان یافته متحول شود .
وی همچنین در بخش دیگری از نوشته خود موسوی را یک رهبر کاریزماتیک ندانسته و خواستارسپردن رهبری فتنه گران به شورای هماهنگی راه سبز شد و نوشت:
این رهبری می باید از پایین به بالا بوده و متعهد به میانگین و فصل مشترک خواسته ها باشد. قطعا در این رهبری موسوی ،کروبی و اطرافیان شان نقشی برجسته خواهند داشت اما حضور در رهبری محدود به آنها نمی شود.